Prestasi yang pernah diraih Jonatan Christie antara lain:
1. Gold Medal Asian Games 2018
2. Gold Medal Kejuaraan Tim Bulu Tangkis Asia beregu putra tahun 2016, 2018, dan 2020
3. Gold Medal SEA GAMES 2017
4. Gold Medal beregu putra SEA GAMES 2015, 2017, DAN 2019
5. Silver Medal Kejuaraan Dunia Junor BWF tahun 2013
6. Gold Medal Australia Open 2019
7. Gold Medal New Zealand Open 2019